淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎的区别主要在于致病菌和临床症状。
淋菌性尿道炎是由淋病奈瑟菌（简称淋球菌）感染引起的，主要通过性接触传播。其潜伏期一般为2~5天，男性患者表现为尿频、尿急、尿痛，尿道口红肿，有脓性分泌物；女性患者表现为宫颈炎、尿道炎，尿道口可有脓性分泌物，外阴可有瘙痒、烧灼感。
非淋菌性尿道炎是由淋球菌以外的其他病原体（如沙眼衣原体、支原体等）感染引起的，主要通过性接触传播。其潜伏期一般为1~3周，男性患者表现为尿道刺痒、尿痛、尿道口红肿，有稀薄分泌物；女性患者表现为宫颈炎、尿道炎，尿道口可有分泌物，外阴可有瘙痒、烧灼感。
需要注意的是，淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎的症状有时会比较相似，而且这两种疾病也可能同时存在。因此，如果出现尿道炎的症状，应及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，避免不洁性行为，以预防尿道炎的发生。