孕晚期肚脐眼凹进去可能是以下原因导致的：
1.腹部增大：随着孕周的增加，子宫逐渐增大，腹部皮肤被拉伸，肚脐眼可能会被牵拉而凹进去。
2.胎儿位置：胎儿在子宫内的位置也可能影响肚脐眼的形状。如果胎儿较大或胎位不正，可能会压迫腹部，导致肚脐眼凹进去。
3.皮肤弹性：孕妇的皮肤弹性也会影响肚脐眼的形状。如果皮肤弹性较好，肚脐眼可能不会明显凹进去；如果皮肤弹性较差，肚脐眼可能更容易凹进去。
4.遗传因素：肚脐眼的形状可能与遗传有关，如果孕妇的家族中有肚脐眼凹进去的情况，那么她本人也可能出现这种现象。
需要注意的是，大多数情况下，孕晚期肚脐眼凹进去是正常的，不会对孕妇和胎儿造成不良影响。但是，如果肚脐眼凹进去的同时伴有疼痛、红肿、渗液等异常情况，或者孕妇出现其他不适症状，如腹痛、阴道流血、胎动异常等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以确保孕妇和胎儿的健康。