月经干净后第3天进行性行为是否会怀孕，主要与女性的月经周期、排卵时间以及是否采取避孕措施等因素有关。一般来说，月经干净后第3天属于安全期，但仍有怀孕的可能，具体分析如下：
1.一般不会怀孕：如果女性的月经周期规律，排卵时间比较固定，通常在下次月经来潮前14天左右。而排卵前后4-5天为易孕期，其他时间则为安全期。因此，月经干净后第3天可能还处于安全期，怀孕的几率相对较小。
2.可能会怀孕：虽然月经干净后第3天属于安全期，但女性的排卵时间可能会受到情绪、环境、身体健康状况等因素的影响而发生改变，出现额外排卵。此外，精子在女性体内可存活2-3天，因此安全期也并非绝对安全。如果没有采取避孕措施，仍有怀孕的可能。
需要注意的是，安全期避孕法并不可靠，失败率较高。如果没有怀孕的计划，建议在同房时采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等。此外，第一次同房时，由于处女膜破裂可能会导致少量阴道流血和轻微疼痛，这是正常的生理现象，通常会在1-3天内自行消失。如果出血较多或持续时间较长，应及时就医。同时，建议注意个人卫生，保持外阴清洁，预防感染。