脚趾长小水泡可能是足癣、汗疱疹、湿疹等原因引起的，不同原因的治疗方法不同，具体如下：
1.足癣：是由真菌感染引起的，可导致脚趾间出现水疱、浸渍、糜烂、脱屑等症状。治疗方法包括外用抗真菌药物（如酮康唑乳膏、克霉唑乳膏等）、口服抗真菌药物（如伊曲康唑胶囊、特比萘芬片等）。同时，要注意保持足部清洁干燥，勤洗脚，勤换鞋袜。
2.汗疱疹：病因尚不明确，可能与过敏、感染、精神因素等有关。表现为手掌或脚掌出现水疱，有时会伴有瘙痒或烧灼感。治疗方法主要是外用糖皮质激素（如糠酸莫米松乳膏、丁酸氢化可的松乳膏等）、炉甘石洗剂等，瘙痒明显时可口服抗组胺药物（如氯雷他定片、盐酸左西替利嗪片等）。
3.湿疹：是一种由多种内外因素引起的皮肤炎症反应，可发生在脚趾等部位。表现为红斑、丘疹、水疱、渗出、结痂等。治疗方法包括外用糖皮质激素（如卤米松乳膏、糠酸莫米松乳膏等）、润肤剂、抗生素等，严重者可口服抗组胺药物、免疫抑制剂等。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体用药应在医生的指导下进行。同时，要避免搔抓患处，以免引起感染。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。