跑步过后小腿肌肉疼痛的原因主要有以下几点：
1.乳酸堆积：跑步时肌肉进行了高强度的运动，产生了大量的乳酸，如果不能及时代谢，就会导致乳酸堆积，引起小腿肌肉疼痛。
2.肌肉纤维损伤：跑步时肌肉反复收缩，可能会导致肌肉纤维损伤，引起疼痛。
3.肌肉痉挛：跑步时肌肉突然收缩，可能会导致肌肉痉挛，引起疼痛。
4.缺乏热身和拉伸：跑步前如果没有充分热身，跑步后没有及时拉伸，也容易导致小腿肌肉疼痛。
5.鞋子不合适：跑步时如果鞋子不合适，也可能会导致小腿肌肉疼痛。
6.其他原因：如扁平足、下肢静脉曲张等，也可能会导致跑步后小腿肌肉疼痛。
针对以上原因，可以采取以下措施缓解疼痛：
1.休息：停止跑步，让小腿肌肉得到充分的休息。
2.按摩：对小腿肌肉进行按摩，帮助缓解肌肉紧张，促进血液循环。
3.热敷：用热毛巾或热水袋对小腿肌肉进行热敷，帮助缓解疼痛。
4.拉伸：对小腿肌肉进行拉伸，帮助放松肌肉，缓解疼痛。
5.药物治疗：如果疼痛比较严重，可以在医生的指导下使用药物治疗，如非甾体抗炎药等。
6.物理治疗：如冲击波治疗、中频电疗等，也可以帮助缓解疼痛。
7.就医治疗：如果疼痛持续时间较长，或者伴有其他症状，如肿胀、麻木等，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。
总之，跑步过后小腿肌肉疼痛可能是多种原因引起的，如果疼痛比较严重，应及时采取措施缓解疼痛，同时注意休息和保暖，避免再次受伤。如果疼痛持续时间较长，或者伴有其他症状，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。