新生儿脖子淹了，可在医生的指导下涂抹以下药物：
1.鞣酸软膏：具有收敛、滋润和保护皮肤的作用，能缓解皮肤炎症。
2.百多邦软膏：主要成分为莫匹罗星，对皮肤感染具有治疗作用。
3.红霉素软膏：属于抗生素类药物，可用于治疗皮肤感染。
在涂抹药物之前，需要先清洁宝宝的脖子，然后轻轻擦干。涂抹药物时，应注意不要涂得太厚，以免影响皮肤的呼吸。
需要注意的是，如果宝宝的脖子淹得比较严重，或者出现了红肿、破皮等症状，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，在日常生活中，要注意保持宝宝脖子的清洁和干燥，及时更换尿布，避免过度摩擦。