脖子两侧疼不一定是甲状腺疾病，甲状腺疾病可能会引起脖子疼，但脖子疼还可能由其他原因引起。
引起脖子疼的常见原因主要有以下几种：
1.颈部肌肉劳损：长期低头、伏案工作或使用电子设备等，可导致颈部肌肉紧张、痉挛，引起疼痛。
2.颈椎疾病：如颈椎间盘突出、颈椎管狭窄等，可压迫颈部神经根或椎动脉，引起脖子疼、上肢麻木、无力等症状。
3.颈部外伤：如扭伤、落枕、颈部挫伤等，可导致颈部肌肉、韧带损伤，引起疼痛。
4.感染：如扁桃体炎、咽炎等可引起颈部淋巴结肿大，导致脖子疼。
5.其他：如食管炎、食管癌等可引起颈背部牵涉痛，表现为脖子疼。
甲状腺疾病引起的脖子疼，常见于以下几种情况：
1.亚急性甲状腺炎：可导致甲状腺部位疼痛，并可放射至颈部、耳部、下颌等部位，伴有发热、乏力等全身症状。
2.桥本甲状腺炎：可出现甲状腺肿大，伴有疼痛、压痛。
3.甲状腺功能亢进：部分患者可出现颈部血管杂音、震颤，并伴有甲亢的其他症状，如心悸、手抖、怕热、多汗等。
4.甲状腺癌：少数情况下，甲状腺癌可侵犯周围组织，引起脖子疼。
需要注意的是，脖子疼还可能由其他原因引起，如纵隔肿瘤、白血病等。如果脖子疼持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，进行详细的检查，如颈部超声、甲状腺功能检查、血常规等，以明确病因，并进行针对性治疗。