会厌囊肿手术后可能出现以下后遗症：
1.出血：手术中或手术后可能出现出血，需要密切观察呼吸情况，如有异常应及时处理。
2.感染：手术后可能会发生感染，表现为发热、咽痛等症状。需要使用抗生素进行治疗。
3.疼痛：手术后可能会出现颈部疼痛，可通过口服止痛药缓解。
4.吞咽困难：手术后可能会出现吞咽困难，这是由于手术部位肿胀或疼痛引起的，通常会在数天至数周内逐渐缓解。
5.声音嘶哑：手术可能会影响声带的运动，导致声音嘶哑。这种情况通常会在几周内逐渐恢复。
6.呼吸困难：在极少数情况下，手术后可能会出现呼吸困难，需要及时处理。
需要注意的是，这些后遗症并不是一定会发生的，而且大多数情况下是可以通过适当的治疗和护理来缓解的。在手术后，患者需要遵循医生的建议进行护理，包括饮食、休息等方面的注意事项。如果出现异常症状，应及时就医。