三个月宝宝拉肚子，纯母乳喂养，可能是生理性腹泻，也可能是乳糖不耐受或其他原因引起。以下是一些建议：
1.观察宝宝的情况：注意宝宝的精神状态、食欲、体重增长等情况。如果宝宝精神好、食欲正常、体重增长良好，可能是生理性腹泻，不需要特殊处理。如果宝宝精神萎靡、食欲不振、体重增长缓慢，需要及时就医。
2.调整妈妈的饮食：如果宝宝拉肚子是由妈妈饮食引起的，妈妈应避免食用油腻、辛辣、生冷等食物。
3.注意宝宝的腹部保暖：可以用热水袋或热毛巾给宝宝敷肚子，但要注意温度，避免烫伤宝宝。
4.给宝宝补充水分：如果宝宝拉肚子导致水分丢失过多，需要及时补充水分，可以给宝宝喂一些白开水或口服补液盐。
5.给宝宝服用益生菌：益生菌可以调节肠道菌群，有助于缓解宝宝拉肚子的症状。
6.及时就医：如果宝宝拉肚子的症状持续不缓解或加重，应及时就医，医生会根据宝宝的具体情况进行诊断和治疗。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，如果对宝宝的拉肚子情况有任何疑问，最好咨询医生的意见。