总想上厕所小便且有时伴有疼痛，可能与以下因素有关：
1.泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎等，炎症刺激可导致尿频、尿急、尿痛。还可能伴有尿液混浊、异味等症状。可遵医嘱使用抗生素进行治疗，如左氧氟沙星、阿莫西林等。
2.前列腺炎：男性患者中较为常见，可出现尿频、尿急、尿痛，同时伴有会阴部、耻骨上区疼痛等症状。治疗前列腺炎的药物有前列舒通胶囊、前列康等。
3.前列腺增生：多见于老年男性，可引起尿频、尿急、尿不尽、排尿困难等症状。特拉唑嗪、非那雄胺等药物可用于治疗前列腺增生。
4.泌尿系统结石：如膀胱结石、尿道结石等，可刺激尿路黏膜，引起尿频、尿急、尿痛，还可能伴有血尿。较小的结石可通过多喝水、多运动自行排出，较大的结石可能需要进行体外冲击波碎石或手术取石。
5.其他：如膀胱癌、肾盂肾炎等也可能导致类似症状。
如果出现总想上厕所小便且有时伴有疼痛的情况，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、泌尿系统超声等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。