新生婴儿手上长小水泡，可能是以下原因引起：
1.汗疱疹：汗疱疹是一种对称发生在手掌、脚底和手指、脚趾侧缘的水疱性皮肤病。可能与遗传、过敏、感染、神经精神因素等有关。汗疱疹通常伴有不同程度的瘙痒和烧灼感，水疱干涸后会出现蜕皮。
2.手足口病：手足口病是由肠道病毒引起的传染病，主要通过密切接触患者的粪便、疱疹液、鼻咽分泌物、唾液及接触被污染的手、毛巾、手绢、牙杯、玩具、餐具、奶瓶、床上用品等物品或环境而感染。手足口病多发生于5岁以下儿童，表现为口腔黏膜、手、足、臀部出现斑丘疹、疱疹，疱疹周围可有炎性红晕，疱内液体较少。部分患者可伴有咳嗽、流涕、食欲不振等症状。
3.水痘：水痘是由水痘-带状疱疹病毒初次感染引起的急性传染病。主要发生在婴幼儿和学龄前儿童，成人发病症状比儿童更严重。水痘传染性强，水痘结痂前均具有传染性。水痘皮疹首先出现于躯干和头部，后延及四肢，呈向心性分布。初为红色斑疹和丘疹，继之变为透明饱满的水疱，疱壁薄易破，常有瘙痒。
4.湿疹：湿疹是由多种内外因素引起的瘙痒剧烈的一种皮肤炎症反应。湿疹病因复杂，常为内外因相互作用结果。内因如慢性消化系统疾病、精神紧张、失眠、过度疲劳、情绪变化、内分泌失调、感染、新陈代谢障碍等，外因如生活环境、气候变化、食物等均可影响湿疹的发生。湿疹急性期表现为红斑、丘疹、水疱，可伴有渗出、结痂。慢性期表现为皮肤增厚、粗糙、苔藓样变。
5.其他：如手足口病、药物疹、蚊虫叮咬等也可引起手上长小水泡。
如果新生婴儿手上长小水泡，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持婴儿手部清洁干燥，避免搔抓，以免引起感染。