大姨妈三个月没来了，确定没怀孕，可能是以下原因引起：
1.内分泌失调：如果长期的精神压抑、紧张或遭受重大精神刺激和心理创伤，都可能导致月经失调，甚至闭经。此外，长期的熬夜、劳累或节食减肥，也可能导致身体的内分泌紊乱，从而影响月经周期。除了月经失调外，还可能出现皮肤色斑、痤疮等问题。
2.卵巢早衰：如果女性的年龄小于40岁，卵巢功能出现衰退，就会导致雌激素水平下降，从而引起月经紊乱，甚至闭经。此外，还可能出现潮热、盗汗、心烦、失眠等症状。
3.多囊卵巢综合征：这是一种常见的妇科内分泌疾病，可能与遗传、环境等因素有关。患者可能会出现月经稀发、闭经、高雄激素血症、胰岛素抵抗等症状，还可能会导致不孕。
4.其他因素：如果患有甲状腺功能亢进或减退、肾上腺皮质功能亢进或减退等疾病，也可能会影响月经周期。此外，过度运动、体重下降过快等也可能导致闭经。
如果出现大姨妈三个月没来的情况，建议及时就医，进行相关的检查和治疗。同时，保持良好的生活习惯和心态，也有助于调节月经周期。