目前，亲子鉴定主要有以下几种方法：
1.外貌对比：
这种方法是通过比较待测者和其生父的外貌特征来确定亲子关系。然而，这种方法的准确性较低，因为外貌特征可能受到环境、生活习惯等因素的影响而发生变化。
2.滴骨验亲：
这种方法是指在古代，人们认为如果死者的血滴在生者的骨头上，会渗入骨内，否则就不会渗入。这种方法没有科学依据，因为血型和DNA是不同的遗传物质，它们的检测方法和意义也不同。
3.滴血验亲：
这种方法是指在古代，人们认为如果将待测者的血和生父的血滴在同一器皿中，如果两者能够融合，就说明有亲子关系；如果两者不能融合，就说明没有亲子关系。这种方法也是没有科学依据的，因为血型和DNA是不同的遗传物质，它们的检测方法和意义也不同。
4.DNA鉴定：
这是目前最准确、最科学的亲子鉴定方法。人的血液、毛发、唾液、口腔细胞及骨头等都可以用于亲子鉴定，十分方便。
一个人有23对（46条）染色体，同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。如果检测到某个DNA位点的等位基因，一个与母亲相同，另一个就应与父亲相同，否则就存在疑问了。
利用DNA进行亲子鉴定，只要作十几至几十个DNA位点作检测，如果全部一样，就可以确定亲子关系，如果有3个以上的位点不同，则可排除亲子关系，有一两个位点不同，则应考虑基因突变的可能，加做一些位点的检测进行辨别。DNA亲子鉴定，否定亲子关系的准确率几近100%，肯定亲子关系的准确率可达到99.99%。
现代的亲子鉴定技术还能检测出亲缘关系的程度，比如双胞胎的DNA序列是完全一样的。
DNA鉴定还可以用于一些疑难的亲缘关系认定，比如父母皆疑（无）的同胞（兄弟、兄妹、姐弟、姐妹）、表兄妹关系的鉴定，叔侄之间、姨和外甥女之间、舅舅与外甥（外甥女）之间的亲缘关系鉴定等。