怀孕后孕酮低的原因主要有以下几点：
1.黄体功能不全：怀孕后，黄体分泌孕酮不足，可能导致孕酮水平低。这可能与黄体发育不良、过早退化或萎缩有关。
2.肾上腺、甲状腺功能失调：肾上腺、甲状腺功能失调，会影响卵巢功能，导致孕酮分泌不足。
3.先兆流产、宫外孕：如果怀孕后出现先兆流产或宫外孕，也可能导致孕酮低。
4.其他：孕妇本身患有糖尿病、胰岛素抵抗等疾病，也可能影响孕酮的代谢。
需要注意的是，孕酮水平低并不一定意味着一定会流产，但需要密切关注，并在医生的指导下进行治疗和监测。如果出现阴道流血、腹痛等异常症状，应及时就医。