卵巢囊肿的病因尚不完全清楚，可能与以下因素有关。
1.遗传因素：部分卵巢囊肿患者存在家族遗传倾向。
2.内分泌因素：卵巢是排卵、分泌性腺激素的重要器官，卵巢囊肿多发生于内分泌旺盛的生育年龄，所以认为与内分泌失调有关。
3.生活方式：长期的饮食结构、生活习惯不好、心理压力过大，可以出现生理性卵巢囊肿和卵巢真性肿物。
4.环境因素：食物的污染，如蔬菜等使用的植物生长激素，如家畜家禽等配方饲养中瘦肉精类的激素成分。
5.炎症因素：长期的慢性炎症刺激，可引起输卵管卵巢炎、子宫内膜异位症等，继而发生卵巢囊肿。