跑完步后膝盖内部疼痛，可能与以下原因有关：
1.运动过度：如果跑步的时间过长、强度过大，或者跑步的姿势不正确，可能会导致膝盖过度磨损，引起疼痛。
2.半月板损伤：半月板是位于膝关节内的软骨结构，具有缓冲和稳定膝关节的作用。如果在跑步过程中半月板受到损伤，也会引起膝盖内部疼痛。
3.髌股关节综合征：髌股关节是膝关节的重要组成部分，如果髌股关节的压力过高或不平衡，可能会导致髌股关节综合征，引起膝盖疼痛。
4.滑膜炎：滑膜炎是一种炎症性疾病，可导致滑膜分泌过多的液体，引起膝关节肿胀和疼痛。
5.其他原因：其他可能导致膝盖内部疼痛的原因包括韧带损伤、软骨损伤、髌骨软化症等。
如果跑完步后膝盖内部疼痛，建议采取以下措施：
1.休息：停止跑步，给膝盖足够的休息时间，避免进一步损伤。
2.冰敷：用冰袋或冷毛巾敷在膝盖上，每次15-20分钟，每天数次，有助于减轻疼痛和肿胀。
3.加压包扎：使用弹性绷带包扎膝盖，可减轻肿胀。
4.抬高患肢：将患肢抬高，高于心脏水平，有助于促进血液回流，减轻肿胀。
5.物理治疗：可以进行热敷、按摩、电疗等物理治疗，缓解疼痛和促进恢复。
6.药物治疗：如果疼痛严重，可以口服非甾体类抗炎药（如布洛芬、对乙酰氨基酚等）缓解疼痛。
7.就医：如果疼痛持续不缓解或加重，或者出现其他症状，如肿胀、活动受限等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，并根据医生的建议进行治疗。
此外，为了预防跑步后膝盖疼痛，建议采取以下措施：
1.逐渐增加跑步的强度和时间，避免过度运动。
2.注意跑步姿势，保持正确的身体姿势和步伐。
3.选择合适的跑鞋，提供良好的支撑和缓冲。
4.进行热身和拉伸运动，准备活动和放松活动。
5.保持适当的体重，减轻膝盖的负担。
6.如果有膝盖受伤或疾病史，应在医生的指导下进行跑步。
需要注意的是，每个人的身体状况和疼痛原因可能不同，如果对膝盖疼痛的原因和治疗有疑问，建议咨询医生或物理治疗师的意见。