肛门两侧红红的摸着疼，可能与以下原因有关：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，可导致肛门疼痛、出血和瘙痒。常发生于肛门后侧，排便时疼痛加剧。
2.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，可表现为肛门疼痛、肿胀、发热等症状。
3.肛窦炎：肛窦炎是指肛窦部的炎症，常伴有肛门部下坠感、疼痛等症状。
4.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，可引起肛门括约肌痉挛，导致疼痛。
5.其他：肛门湿疹、肛门尖锐湿疣、肛管或直肠肿瘤等也可能出现肛门疼痛、红肿等症状。
如果出现肛门两侧红红的摸着疼的情况，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。以下是一些可能的治疗方法：
1.药物治疗：根据病因不同，可使用抗生素、外用药膏、栓剂等进行治疗。
2.坐浴：用温水或中药坐浴，可缓解疼痛、促进局部血液循环。
3.手术治疗：对于严重的肛裂、肛周脓肿等疾病，可能需要手术治疗。
4.其他治疗：如激光、冷冻等治疗方法，也可用于治疗肛门疾病。
此外，在治疗期间，应注意保持肛门清洁，避免久坐、久站，避免食用辛辣刺激性食物，保持大便通畅。同时，应注意个人卫生，勤换内裤，避免感染加重。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医复诊。