手指甲凹陷可能是由多种原因引起的，以下是一些常见的原因：
1.营养不良：缺乏某些营养素，如铁、蛋白质、维生素等，可能导致手指甲凹陷。
2.甲癣：由真菌感染引起的指甲病变，可导致指甲变形、凹陷。
3.银屑病：这是一种慢性炎症性皮肤病，指甲病变是其常见表现之一，可能出现凹陷、增厚、变色等。
4.扁平苔藓：一种自身免疫性疾病，可累及皮肤和黏膜，指甲病变表现为凹陷、纵嵴等。
5.湿疹：皮肤炎症性疾病，也可能影响指甲，导致指甲凹陷、粗糙。
6.外伤：指甲受到外伤，如挤压、碰撞等，可能导致指甲凹陷。
7.其他：某些系统性疾病，如心脏病、糖尿病、甲状腺功能异常等，也可能引起指甲变化。
如果发现手指甲凹陷，应及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会进行以下检查：
1.身体检查：观察指甲的形态、颜色、质地等，以及身体其他部位的皮肤状况。
2.实验室检查：如血常规、微量元素检查、真菌涂片或培养等，以排除营养不良、感染等原因。
3.其他检查：根据具体情况，可能需要进行皮肤镜检查、自身抗体检测等，以明确诊断。
针对不同的原因，治疗方法也有所不同。以下是一些常见的治疗方法：
1.补充营养素：根据缺乏的营养素进行相应的补充，如缺铁性贫血可补充铁剂，维生素缺乏可补充相应的维生素。
2.抗真菌治疗：如果是甲癣，需要使用抗真菌药物进行治疗。
3.治疗原发疾病：对于银屑病、扁平苔藓等自身免疫性疾病，需要积极治疗原发疾病。
4.外用药物：可使用角质促成剂、角质松解剂等药物，帮助改善指甲症状。
5.注意护理：保持指甲清洁，避免过度修剪，避免接触刺激性物质。
需要注意的是，某些严重的疾病，如心脏病、糖尿病等，可能导致指甲凹陷，因此对于长期存在的指甲凹陷，尤其是伴有其他症状时，应及时就医，进行全面的检查和治疗。此外，对于儿童和孕妇，如果出现指甲凹陷，应特别关注，因为某些疾病在这两个群体中可能有特殊的表现和影响。
如果您对指甲凹陷的原因和治疗有任何疑问，建议咨询皮肤科医生或其他专业医生，以获得更详细和个性化的建议。