早上起来咳嗽严重的原因可能有以下几种：
1.上呼吸道感染：夜间睡眠时，呼吸道分泌物可能会积聚在喉咙和气管中，早上起床后，通过咳嗽可以将这些分泌物排出体外，从而导致咳嗽加重。
2.咳嗽变异性哮喘：这是一种特殊类型的哮喘，主要表现为刺激性干咳，通常在夜间和清晨发作或加重。
3.鼻后滴注综合征：鼻腔分泌物倒流至喉咙，刺激咳嗽感受器，也会引起咳嗽。
4.胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和喉部，也可能导致咳嗽。
5.其他原因：如过敏、气道高反应性、慢性阻塞性肺疾病等。
如果咳嗽严重影响生活或持续时间较长，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸片或CT、肺功能等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，保持室内空气湿润、避免吸烟等也有助于缓解咳嗽症状。