早晨起来眼睛发肿可能是以下原因引起：
1.生理性因素：
睡前大量饮水：夜间肾脏对水分的重吸收减少，导致体内水分潴留，晨起时可出现眼睛发肿。
枕头过低：睡眠时头部位置过低，可导致面部及眼部血液回流不畅，引起眼睛发肿。
睡眠不足：长期睡眠不足或熬夜，可导致眼部血液循环减慢，引起眼睛发肿。
过敏：接触过敏原后，可引起眼部过敏反应，导致眼睛发肿。
生理周期：女性在生理周期前后，体内激素水平变化，可导致眼睑水肿。
2.病理性因素：
肾脏疾病：如肾小球肾炎、肾病综合征等，可导致肾脏滤过功能下降，引起水钠潴留，出现眼睑或全身水肿。
心脏疾病：如心力衰竭，可导致静脉回流受阻，引起身体低垂部位水肿，也可出现眼睛发肿。
肝脏疾病：如肝硬化，可导致蛋白合成减少，引起低蛋白血症，出现全身性水肿。
营养不良：长期营养不良，可导致低蛋白血症，引起水肿。
内分泌疾病：如甲状腺功能减退，可导致黏液性水肿，出现眼睑或全身水肿。
其他：如特发性水肿、血管神经性水肿等。
如果早晨起来眼睛发肿持续不缓解或伴有其他症状，如头痛、恶心、呕吐、视力下降等，应及时就医，进行相关检查，如尿常规、肾功能、心脏超声、甲状腺功能等，以明确病因，并进行针对性治疗。