同房后三天小腹隐疼不一定是怀孕，可能是其他原因引起的。以下是一些可能的原因：
1.盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症。同房时，男性生殖器可能会将细菌带入女性体内，引起盆腔炎，导致小腹疼痛。
2.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位。同房时，子宫收缩可能会导致异位的子宫内膜出血，引起小腹疼痛。
3.排卵痛：在排卵期，卵巢会释放卵子，这个过程可能会引起小腹疼痛，称为排卵痛。
4.其他：同房时动作过于剧烈、精神紧张、压力过大等也可能导致小腹疼痛。
如果同房后三天小腹隐疼持续不缓解，或者伴有其他症状，如发热、阴道分泌物异常、性交痛等，应及时就医，进行相关检查，如B超、白带常规等，以明确病因，并进行针对性治疗。
此外，如果怀疑自己怀孕，可以在同房后10天左右进行早孕试纸检测或到医院进行血HCG检查，以确定是否怀孕。
总之，同房后三天小腹隐疼不一定是怀孕，需要结合具体情况进行分析。如果有其他异常症状，应及时就医，以便早期诊断和治疗。