肾结石后腰疼的原因主要有以下几点：
1.结石移动：肾结石在排出过程中，可能会在肾盂、输尿管或尿道等部位移动，刺激或阻塞尿路，引起平滑肌痉挛，导致肾绞痛，从而出现腰疼。
2.炎症反应：结石可能会导致尿路梗阻，引起肾盂肾炎或输尿管炎等炎症，炎症刺激会引起腰疼。
3.神经反射：肾脏的神经与腰部的神经有共同的起源和分布，肾结石引起的疼痛可能会通过神经反射引起腰部疼痛。
4.并发症：肾结石可能会引起肾积水、感染、血尿等并发症，这些并发症也可能会导致腰疼。
针对肾结石后腰疼的治疗方法如下：
1.止痛治疗：如果疼痛较轻，可以采用热敷、按摩等方法缓解疼痛；如果疼痛剧烈，可以使用止痛药物，如吗啡、杜冷丁等。
2.排石治疗：如果结石较小，可以通过多喝水、多运动等方法促进结石排出；如果结石较大，可以采用体外冲击波碎石、输尿管镜取石术等方法治疗。
3.抗感染治疗：如果结石引起了感染，可以使用抗生素进行抗感染治疗。
4.其他治疗：如果结石导致了严重的肾积水、肾功能损害等并发症，可能需要进行手术治疗。
总之，肾结石后腰疼的原因较为复杂，需要根据具体情况进行治疗。如果出现肾结石后腰疼的症状，建议及时就医，进行详细的检查和治疗。