肾结石碎石后腰特别疼，可能与以下因素有关。
1.结石未完全排出：碎石后，结石可能会变小，但仍可能部分残留，导致输尿管堵塞，引起疼痛。
2.肾积水：碎石过程中，可能会导致短暂的肾积水，积水会压迫周围组织，引起疼痛。
3.感染：碎石后，可能会引起感染，导致肾盂肾炎，出现腰痛。
4.其他：碎石过程中，可能会损伤肾脏组织，引起炎症反应，导致疼痛。
针对这种情况，可以采取以下措施。
1.休息：疼痛时应卧床休息，避免剧烈运动。
2.饮水：多喝水，有助于促进结石排出，缓解疼痛。
3.药物治疗：可以使用止痛药物，如布洛芬、对乙酰氨基酚等，缓解疼痛。同时，还可以使用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等，预防感染。
4.观察病情：如果疼痛持续不缓解，或出现发热、血尿等症状，应及时就医，进行进一步检查和治疗。
5.其他：如果结石较大，或经保守治疗无效，可能需要再次进行碎石或手术治疗。
需要注意的是，每个人的情况不同，治疗方法应根据具体情况而定。在治疗过程中，应密切观察病情变化，如有异常应及时就医。同时，应遵医嘱进行治疗，避免自行用药。