一、增加感染风险
月经没走干净时，女性宫颈口处于相对开放状态，此时同房，外界的细菌等病原体容易进入阴道、子宫甚至盆腔。例如，有研究显示，经期同房使女性患盆腔炎的风险显著增加。因为细菌等病原体一旦进入，可能引发子宫内膜炎、输卵管炎等，这些炎症若长期不愈，可能影响生育功能，导致输卵管粘连、堵塞等，进而造成不孕。对于不同年龄的女性，生殖系统的防御能力有所不同，年轻女性生殖系统相对较为娇嫩，感染风险可能更高；而有过生育史或年龄稍大的女性，也不能掉以轻心，同样可能因感染引发一系列妇科疾病。
二、引起月经紊乱
同房刺激可能会导致子宫收缩，进而影响子宫内尚未完全修复的创面。原本即将停止的月经可能会因为这种刺激而再次出现经量增多、经期延长等情况。比如，一些女性在经期同房后，发现月经持续时间比平时延长了好几天，经量也比正常经期时多。不同生活方式的女性，如长期熬夜、压力大的女性，本身月经就可能不太规律，经期同房更容易加重这种紊乱情况。而有既往月经不调病史的女性，经期同房后月经紊乱的风险会进一步升高。
三、导致抗精子抗体产生
女性在经期，子宫内膜有创面，而且血液中的免疫相关成分可能会发生变化。此时同房，男性的精子进入女性体内，可能会被女性免疫系统识别为“异物”，从而产生抗精子抗体。这种抗体一旦产生，会阻碍精子与卵子结合，影响受孕。对于有生育计划的女性来说，这会是一个较大的问题，可能会导致长期不孕。不同年龄有生育需求的女性，都需要注意经期避免同房，以防止抗精子抗体的产生影响生育。比如年轻的未孕女性，更要重视这一点，因为抗精子抗体的产生可能会在不知不觉中影响未来的受孕过程。