一、增加感染风险
月经没走干净时，女性宫颈口处于相对开放状态，此时同房容易使外界细菌等病原体侵入阴道、宫颈甚至宫腔。例如，有研究表明，月经未净同房后，女性发生盆腔炎的风险显著增加。因为细菌等病原体可顺着开放的宫颈口上行感染，引发子宫内膜炎、输卵管炎等，盆腔炎若反复发作可能影响生育功能，导致输卵管粘连、堵塞等，进而引起不孕不育等问题。对于有性生活史的女性，尤其是未育女性，更应避免这种情况，因为盆腔炎对生育的不良影响较大。
二、导致月经紊乱
月经没走干净时同房，可能会对女性的内分泌系统和子宫收缩产生影响。同房刺激可能会引起子宫强烈收缩，使得还未完全修复的子宫内膜再次出血，从而导致月经经期延长、经量增多。比如一些女性在月经未净同房后，发现月经持续时间比平时延长了好几天，经量也较之前增多。这是因为子宫收缩异常打乱了正常的月经周期调节机制，而不同年龄阶段的女性，其内分泌调节能力有所不同，相对来说年轻女性的内分泌调节可能更易受这种外界因素干扰，但无论哪个年龄段都应避免月经未净同房。
三、增加妇科炎症发生几率
长期反复出现月经没走干净同房的情况，会使女性患各种妇科炎症的几率大大提升。除了前面提到的盆腔炎，还可能引发阴道炎等。阴道炎会导致阴道瘙痒、白带异常等不适症状，严重影响生活质量。而且炎症之间可能相互影响，比如阴道炎若不及时控制，可能会蔓延感染至宫颈等部位，进一步加重病情。对于有妇科炎症病史的女性，月经未净同房会使炎症复发或加重的风险更高，需要特别注意经期卫生和避免经期同房。