生殖器上长小疙瘩可能是多种原因引起的，以下是一些可能的原因和消除方法：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性传播。小疙瘩通常呈乳头状、菜花状或鸡冠状，质地柔软，易出血。治疗方法包括冷冻、激光、电灼、手术切除等，同时可使用免疫调节剂辅助治疗。
2.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，主要通过性接触传播。初期表现为生殖器部位的红斑、丘疹，很快形成水疱，疱液澄清，疱壁薄易破，可伴有疼痛、瘙痒等症状。治疗方法主要是抗病毒药物，如阿昔洛韦、伐昔洛韦等。
3.梅毒：由梅毒螺旋体感染引起，主要通过性传播。一期梅毒表现为生殖器部位的无痛性溃疡，称为硬下疳；二期梅毒可出现全身皮疹。治疗方法主要是使用青霉素。
4.珍珠状阴茎丘疹：常见于青壮年男性，与包皮过长、局部刺激有关。丘疹多发生在冠状沟边缘，呈珍珠状，白色或淡红色，互不融合。一般不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光、冷冻等方法去除丘疹。
5.皮脂腺异位症：病因不明，可能与内分泌因素、局部刺激等有关。表现为粟粒大小的淡白色或淡黄色丘疹，可密集分布或融合成片。一般不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光、电灼等方法去除丘疹。
6.其他：生殖器部位还可能出现传染性软疣、脂肪瘤、皮脂腺囊肿等疾病，这些疾病的治疗方法也各不相同。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体情况建议及时就医，进行相关检查，明确诊断后，在医生的指导下选择合适的治疗方法。同时，要注意个人卫生，保持生殖器清洁干燥，避免搔抓、摩擦，避免不洁性生活。