生殖器上有黑色小疙瘩可能是多种疾病的表现，以下是一些可能的原因和建议：
1.色素痣：这是一种常见的良性皮肤肿瘤，通常是黑色或棕色的，表面光滑。如果色素痣没有变化，不需要特殊处理。如果色素痣突然增大、出血、瘙痒或疼痛，可能是恶变的迹象，需要及时就医。
2.尖锐湿疣：这是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病，通常表现为生殖器上的疣状赘生物，颜色可以是灰色、棕色或黑色。尖锐湿疣可以通过性接触传播，也可以通过接触感染者的衣物、毛巾等物品传播。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法。
3.阴茎珍珠疹：这是一种常见的良性病变，通常发生在龟头边缘，表现为白色或黄色的小丘疹，排列成一行或多行。阴茎珍珠疹不需要特殊治疗，也不会传染。
4.扁平湿疣：这是二期梅毒的一种表现，通常发生在生殖器上，表现为扁平的丘疹，颜色可以是黑色或棕色。扁平湿疣具有传染性，需要及时就医，进行梅毒血清学检查和治疗。
5.其他：生殖器上的黑色小疙瘩还可能是黑色素瘤、鲍恩病、恶性雀斑样痣等疾病的表现。如果黑色小疙瘩持续存在或伴有其他症状，如疼痛、瘙痒、出血、溃疡等，应及时就医，进行详细的检查和诊断。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因和建议，具体情况需要根据个人的症状、体征和检查结果来确定。如果对生殖器上的黑色小疙瘩有疑虑，应及时就医，避免自行诊断和治疗。同时，应注意保持生殖器的清洁和卫生，避免搔抓和摩擦，避免使用刺激性的清洁剂和化妆品。如果有性伴侣，应同时就医，进行检查和治疗，避免交叉感染。