孕后期肛门有肉突出疼，可能是以下原因引起：
1.内痔或混合痔：怀孕后，子宫逐渐增大，可能压迫下腔静脉，导致痔静脉回流受阻，引起内痔或混合痔。此时，肛门周围可能出现肿物，并伴有疼痛、瘙痒、出血等症状。
2.肛裂：怀孕后，由于增大的子宫压迫直肠，导致粪便在肠道内停留时间过长，粪便干结，排便时用力过大，可能导致肛裂。肛裂会引起肛门疼痛、出血、便秘等症状。
3.血栓性外痔：怀孕后，由于子宫增大，压迫下腔静脉，导致静脉回流受阻，容易形成血栓。血栓性外痔会引起肛门剧痛，肿物表面皮肤呈青紫色。
4.其他：怀孕后，体内激素水平变化，可能导致肛门局部皮肤湿疹、感染等，也会出现肛门疼痛、肿物等症状。
针对以上情况，可以采取以下措施：
1.调整饮食：多吃蔬菜、水果、粗粮等富含膳食纤维的食物，避免辛辣、刺激性食物，预防便秘。
2.养成良好的排便习惯：每天定时排便，避免排便时间过长。
3.保持肛门局部清洁：便后用温水清洗肛门，保持局部清洁干燥。
4.局部热敷：用热毛巾或热水袋热敷肛门，促进血液循环，缓解疼痛。
5.药物治疗：如果疼痛严重，可以在医生的指导下使用局部外用药物，如痔疮膏、痔疮栓等。如果合并感染，还需要使用抗生素治疗。
6.就医治疗：如果以上措施不能缓解症状，或者出现发热、肛门局部红肿、流脓等症状，需要及时就医，进行进一步的检查和治疗。医生可能会根据具体情况，采取手术治疗、坐浴等方法。
需要注意的是，在治疗过程中，应遵循医生的建议，注意个人卫生，保持良好的生活习惯。同时，应定期产检，及时了解胎儿的发育情况。如果对肛门突出的肉有疑虑，应及时就医，以便明确诊断。