小腹隐隐作痛、腰疼可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎等，炎症刺激可导致小腹疼痛和腰疼。还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。治疗一般采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。
2.盆腔炎：女性盆腔内生殖器官及其周围的结缔组织、盆腔腹膜发生炎症时，可引起小腹疼痛、腰疼。可能伴有白带异常、月经失调等症状。治疗方法包括使用抗生素、物理治疗等。
3.宫颈炎、宫颈糜烂：炎症可刺激腰骶部神经引起疼痛，有时可伴有下腹坠胀感、阴道分泌物增多等症状。治疗可采用外用栓剂、激光、冷冻等方法。
4.子宫内膜异位症：具有生长功能的子宫内膜组织出现在子宫腔被覆黏膜以外的其他部位时，可导致痛经、性交痛、月经失调等症状，疼痛可放射至腰骶部、肛门、大腿等部位。治疗方法包括药物治疗、手术治疗等。
5.排卵性腹痛：在两次月经中间，即排卵期，由于卵泡破裂，卵泡液对腹膜的刺激，有些女性会出现下腹疼痛、腰疼，这是一种正常的生理现象，一般持续几个小时或1-2天会自行缓解。
6.其他：如异位妊娠、子宫肌瘤、卵巢肿瘤等也可能引起小腹疼痛和腰疼。
如果出现小腹隐隐作痛、腰疼的症状，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、尿常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中要注意保持良好的生活习惯，如保持外阴清洁、避免过度劳累、注意保暖等。如果疼痛严重或持续时间较长，应及时就医，以免延误病情。