目前针对舌根淋巴滤泡增生，主要有一般治疗、药物治疗、物理治疗、手术治疗等方法，具体治疗方案的选择因人而异，没有所谓“最好的治疗方法”，需要综合考虑多方面因素，以下是一些相关信息：
1.一般治疗：戒除烟酒，改善工作和生活环境，积极治疗鼻及鼻咽慢性炎性病灶及有关全身性疾病。增强体质，提高机体免疫力，预防急性上呼吸道感染。注意休息，多饮水，吃清淡易消化的食物。
2.药物治疗：局部可用复方硼砂溶液、呋喃西林溶液、淡盐水漱口，各种含片含服。金嗓利咽丸、乐频清口服等。不主张使用抗生素。
3.物理治疗：对咽后壁隆起的淋巴滤泡，可进行激光、冷冻或微波治疗，但治疗范围不宜过广。也可用药物注射，于增生的淋巴滤泡部位注入硬化剂，可使增生的淋巴滤泡缩小。
4.手术治疗：上述方法治疗效果不佳时，可考虑手术治疗，不过手术治疗创伤较大，术后疼痛明显，且会遗留瘢痕，影响咽腔的正常生理功能，故一般不主张手术治疗。