扁平疣的治疗方法主要包括以下几种：
1.物理治疗：
冷冻治疗：利用低温作用于疣体，使组织坏死、脱落。
激光治疗：通过激光的热效应将疣体烧灼、气化。
电灼治疗：利用电流产生的高温将疣体烧灼、炭化。
2.外用药物治疗：
维A酸软膏：调节表皮角质形成细胞的增殖和分化，起到抗病毒作用。
咪喹莫特乳膏：通过诱导机体产生免疫应答来治疗扁平疣。
5-氟尿嘧啶软膏：能抑制细胞的增殖，使疣体坏死、脱落。
3.系统药物治疗：
抗病毒药物：如利巴韦林、干扰素等，可抑制病毒复制，促进疣体消退。
免疫调节剂：如胸腺肽、转移因子等，可调节机体免疫功能，增强抗病毒能力。
4.中医治疗：
中药外洗：使用中药煎汤外洗，如板蓝根、马齿苋、薏苡仁等。
针灸：可选取足三里、三阴交、血海等穴位进行针灸。
中药内服：根据患者的具体情况，辨证论治，选用合适的中药方剂。
需要注意的是，扁平疣的治疗方法应根据患者的具体情况选择，如疣体的数量、大小、分布范围、患者的年龄、免疫状态等。在治疗过程中，患者应注意个人卫生，避免搔抓疣体，以免引起自身接种。同时，要保持良好的生活习惯，避免过度劳累，提高免疫力。如果扁平疣症状较为严重，或治疗后复发，建议及时就医，在医生的指导下进行进一步的治疗。