手指两侧起小水泡，可能是以下原因引起：
1.汗疱疹：为一种手掌、足跖部的水疱性疾病。病因尚不明确，可能与过敏、精神紧张、局部感染、局部多汗、遗传等因素有关。常对称发生于手掌、足跖，深在性小水疱，粟粒至米粒大小，略高出皮肤表面，无炎症反应，疱液干涸后形成衣领状脱屑，自觉瘙痒及烧灼感。
2.手癣：由致病性真菌引起，有传染性。水疱鳞屑型可表现为成群或散在分布于手掌、足底，水疱多自行干涸，继发脱屑。自觉瘙痒，若继发细菌感染，可出现脓疱、肿胀、疼痛。
3.湿疹：病因复杂，常为内外因相互作用结果。内因如慢性消化系统疾病、精神紧张、失眠、过度疲劳、情绪变化、内分泌失调、感染、新陈代谢障碍等，外因如生活环境、气候变化、食物等均可影响湿疹的发生。手部湿疹可表现为多形性皮疹，对称分布，境界不清，可逐渐蔓延至手背、手腕部，常有剧烈瘙痒，易反复发作。
4.接触性皮炎：是皮肤或黏膜接触某些外界物质后，在接触部位发生的炎症反应。表现为红斑、肿胀、丘疹、水疱甚至大疱，自觉瘙痒或灼痛。去除病因后，皮损可逐渐消退。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，手指两侧起小水泡还可能有其他原因。如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，应避免搔抓患处，以免引起感染或加重症状。
对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，手指两侧起小水泡的原因和治疗可能会有所不同。在就医时，应告知医生自己的特殊情况，以便医生进行更个体化的诊断和治疗。此外，在日常生活中，应注意保持手部清洁干燥，避免接触刺激性物质，避免过度洗手等。