黄芩和黄芪都属于中药材，且都具有一定的药用价值，但在植物形态、功效作用、适用病症等方面均存在不同，具体区别如下：
1.植物形态：黄芩是唇形科黄芩属多年生草本植物，根茎肥厚，茎基部伏地，稍木质化，具多数细长的根；黄芪是豆科黄芪属多年生草本植物，全株有毛，高60-100厘米。
2.功效作用：黄芩具有清热燥湿、泻火解毒、止血、安胎的功效，用于治疗湿温、暑湿、胸闷呕恶、湿热痞满、泻痢、黄疸、肺热咳嗽、高热烦渴、血热吐衄、痈肿疮毒、胎动不安等症；黄芪具有补气固表、托疮生肌、利水的功效，用于治疗自汗、盗汗、血痹、浮肿、痈疽不溃或溃久不敛等症。
3.适用病症：黄芩主要用于治疗上呼吸道感染、肺炎、急慢性肠炎、膀胱炎、尿道炎、肾炎、肾盂肾炎、中耳炎、鼻窦炎、乳腺炎、产褥热等疾病；黄芪主要用于治疗气虚乏力、中气下陷、久泻脱肛、便血崩漏、表虚自汗、痈疽难溃、久溃不敛、血虚萎黄、内热消渴、慢性肾炎、蛋白尿、糖尿病等疾病。
需注意，黄芩和黄芪均属于中药材，如需使用，建议在医生的指导下使用，避免自行用药，以免引起不良反应。同时，在使用过程中，应注意观察身体变化，如有不适，应及时就医。