来月经时腰的两侧疼，可能与以下几种情况有关：
1.生理现象：
前列腺素分泌增加：月经期间，女性体内前列腺素分泌增加，可引起子宫收缩，导致腰部疼痛。
盆腔充血：月经期间，盆腔充血，可能会刺激腰部神经，引起疼痛。
2.妇科疾病：
盆腔炎：盆腔炎可导致盆腔粘连，月经期间可能出现腰部疼痛。
子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可导致痛经，疼痛可能放射至腰部。
子宫肌瘤：较大的子宫肌瘤可能压迫腰部神经，引起疼痛。
3.其他因素：
劳累：月经期间过度劳累，可能导致腰部肌肉酸痛。
受凉：腰部受凉，也可能引起疼痛。
如果疼痛不严重，可通过休息、热敷等方法缓解。如果疼痛持续不缓解，或伴有其他症状，如月经异常、白带异常等，应及时就医，进行相关检查，如B超、妇科检查等，以明确病因，并进行针对性治疗。
此外，月经期间应注意保暖，避免劳累，保持心情舒畅，避免食用辛辣、生冷食物。如果疼痛严重，可在医生指导下服用布洛芬、对乙酰氨基酚等止痛药。