一、感染风险增加
大姨妈没走干净时，女性的宫颈口处于相对开放状态，此时同房，外界的细菌等病原体容易进入宫腔，引发感染。例如，有研究表明，经期同房导致盆腔炎的风险显著升高，盆腔炎可引起下腹部疼痛、阴道分泌物增多等症状，若不及时治疗，可能会导致输卵管粘连、阻塞等，影响生育功能。对于不同年龄段的女性，青春期女性生殖系统尚未完全发育成熟，经期同房感染的风险更高；育龄期女性若发生盆腔炎，还可能影响受孕；围绝经期女性身体抵抗力相对较低，感染后恢复可能更缓慢。
二、月经紊乱
大姨妈没走干净就同房，可能会对女性的内分泌系统产生影响，进而导致月经紊乱。因为同房的刺激可能会干扰子宫的正常收缩，影响子宫内膜的修复，使得月经周期、月经量等发生改变。比如，可能出现月经量增多、经期延长等情况。不同生活方式的女性，长期熬夜、吸烟、饮酒等不良生活方式会加重月经紊乱的风险，而规律生活的女性相对受影响较小，但经期同房这一行为本身都会对月经产生不良作用。有既往妇科病史的女性，如子宫内膜异位症等患者，经期同房后月经紊乱的情况可能会更为明显。
三、引发子宫内膜异位症
在月经期间，子宫内膜会有脱落的情况，此时同房时的子宫收缩可能会将子宫内膜碎片挤入盆腔等部位，从而增加子宫内膜异位症的发生风险。子宫内膜异位症会导致痛经进行性加重、性交疼痛、不孕等问题。对于有家族遗传倾向的女性，经期同房引发子宫内膜异位症的可能性相对更高；年轻女性若患有子宫内膜异位症，会严重影响生活质量和生育；已生育过的女性若患病，也可能会出现一系列不适症状。
四、对男性健康的影响（间接相关）
虽然主要是对女性健康有危害，但男性在与经期女性同房后，也可能间接受到影响。例如，女性生殖道的病原体可能会传染给男性，导致男性泌尿系统感染等问题，出现尿频、尿急、尿痛等症状。不同年龄的男性，青壮年男性身体抵抗力相对较好，但感染后仍需及时治疗；老年男性感染后恢复可能相对缓慢。生活方式不健康的男性，如不注意个人卫生等，感染的风险也会增加。