头疼、身上骨头疼的原因可能有以下几种：
一、感染性疾病
1.病毒感染：如流感、普通感冒、新冠病毒感染等，病毒感染后可能出现头疼、全身酸痛等症状。
2.细菌感染：如肺炎链球菌肺炎、脑膜炎等，细菌感染可能导致发热、头疼、骨头疼等全身症状。
3.其他感染：如寄生虫感染、真菌感染等，也可能引起头疼和骨头疼。
二、自身免疫性疾病
1.系统性红斑狼疮：可侵犯全身多个系统和脏器，出现发热、关节痛、皮疹、脱发、口腔溃疡等症状，也可能导致头疼。
2.类风湿关节炎：主要表现为对称性、多关节肿胀、疼痛、畸形等，也可能出现头疼。
3.其他自身免疫性疾病：如干燥综合征、系统性血管炎等，也可能出现头疼、骨头疼等症状。
三、神经系统疾病
1.偏头痛：是一种常见的原发性头痛，常表现为单侧或双侧搏动性头疼，可伴有恶心、呕吐、畏光、畏声等症状，也可能出现全身骨头疼。
2.紧张型头痛：是一种常见的慢性头痛，可表现为头部紧束感、压迫感或钝疼，也可能伴有颈肩部疼痛、全身乏力等症状。
3.其他神经系统疾病：如脑炎、脑膜炎、脑肿瘤等，也可能导致头疼和骨头疼。
四、代谢性疾病
1.低血糖：可导致头疼、心慌、手抖、出汗等症状，严重时可能出现抽搐、昏迷等。
2.尿毒症：由于肾功能衰竭，体内代谢产物潴留，可能出现头疼、乏力、恶心、呕吐等症状。
3.其他代谢性疾病：如甲状腺功能亢进、甲状旁腺功能亢进等，也可能出现头疼、骨头疼等症状。
五、其他原因
1.药物副作用：某些药物可能导致头疼、骨头疼等不良反应，如非甾体抗炎药、抗抑郁药等。
2.精神因素：长期精神紧张、焦虑、压力过大等，可能导致头疼、全身肌肉紧张、疼痛等症状。
3.其他：如中暑、中毒、外伤等，也可能引起头疼和骨头疼。
总之，头疼、身上骨头疼的原因复杂多样，如果症状持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。