“上厕所小便的时候尿道疼”可能是尿道炎、膀胱炎、尿路结石等疾病引起的，也可能是正常的生理现象。以下是对这些情况的具体分析：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、支原体、衣原体等感染引起。除了尿道疼，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。尿道炎需要及时治疗，否则可能会引起膀胱炎、肾盂肾炎等并发症。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也可由细菌感染引起。除了尿道疼，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、下腹疼痛等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎相似。
3.尿路结石：尿路结石是尿液中的晶体物质在肾脏或输尿管等部位形成的固体块状物，可导致尿路梗阻和感染，从而引起尿道疼。此外，尿路结石还可能伴有血尿、恶心、呕吐等症状。尿路结石的治疗方法包括药物治疗、体外冲击波碎石、手术治疗等，具体治疗方法需要根据结石的大小、位置等因素来决定。
4.生理现象：在女性，尿道口与阴道口相邻，阴道口周围有许多细菌，排尿时尿液的冲刷可能会将阴道口的细菌带入尿道，引起尿道疼。这种情况通常是暂时的，多喝水、注意个人卫生即可缓解。此外，性生活过于频繁、长时间憋尿等也可能导致尿道疼，但这些情况通常是暂时的，调整生活习惯后即可缓解。
总之，如果出现“上厕所小便的时候尿道疼”的症状，需要及时就医，明确病因，并进行相应的治疗。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。