两侧腰眼疼可能是由于腰椎间盘突出、腰背肌筋膜炎、第三腰椎横突综合征等原因引起的。以下是可能的原因和治疗方法：
1.腰椎间盘突出：
病因：腰椎间盘各部分（髓核、纤维环及软骨板），尤其是髓核，有不同程度的退行性改变后，在外力因素的作用下，椎间盘的纤维环破裂，髓核组织从破裂之处突出（或脱出）于后方或椎管内，导致相邻脊神经根遭受刺激或压迫，从而产生腰部疼痛，一侧下肢或双下肢麻木、疼痛等一系列临床症状。
病因导致症状的原理：当腰椎间盘发生退行性改变或遭受外力时，纤维环部分或全部破裂，髓核从裂口脱出，刺激或压迫腰脊神经根，引起腰痛和下肢放射痛。
治疗方法：
一般治疗：包括卧床休息、佩戴腰围、腰背肌功能锻炼等。
物理治疗：如热敷、按摩、针灸、牵引等，可以缓解疼痛和肌肉紧张。
药物治疗：包括非甾体抗炎药、肌肉松弛剂、营养神经药物等，可以缓解疼痛和炎症。
手术治疗：如果保守治疗无效，或症状严重影响生活质量，可以考虑手术治疗。
2.腰背肌筋膜炎：
病因：腰背肌筋膜炎是指因寒冷、潮湿、慢性劳损而使腰背部肌筋膜及肌组织发生水肿、渗出及纤维性变，而出现的一系列临床症状。
病因导致症状的原理：寒冷、潮湿、慢性劳损等因素可使腰背部肌肉、筋膜组织发生无菌性炎症，炎症刺激可引起腰背部疼痛，疼痛可在劳累、阴天或气候变化时加重。
治疗方法：
一般治疗：注意保暖，避免长时间弯腰或久坐，适当进行腰背肌锻炼。
物理治疗：如热敷、按摩、红外线照射等，可以缓解疼痛和肌肉紧张。
药物治疗：包括非甾体抗炎药、肌肉松弛剂、活血化瘀中药等，可以缓解疼痛和炎症。
3.第三腰椎横突综合征：
病因：第三腰椎横突综合征是由于第三腰椎横突过长，或横突附近有较多的肌筋膜附着，因急、慢性损伤而引起的综合征。
病因导致症状的原理：第三腰椎横突较长，且是腰方肌和腰大肌的起点，因此此处的肌肉筋膜容易受到损伤，从而引起腰痛，并可向臀部及下肢放射。
治疗方法：
一般治疗：注意休息，避免腰部过度劳累。
物理治疗：如热敷、按摩、针灸等，可以缓解疼痛和肌肉紧张。
药物治疗：包括非甾体抗炎药、活血化瘀中药等，可以缓解疼痛和炎症。
局部封闭治疗：如果疼痛严重，可在局部痛点进行封闭治疗。
总之，两侧腰眼疼的原因较多，治疗方法也不同。如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。