13岁女孩月经发黑可能是正常的，也可能是由疾病引起的。如果女孩在月经初潮后的1-2年内出现月经发黑，且没有其他不适症状，可能是由于下丘脑-垂体-卵巢轴（HPO轴）尚未发育成熟，激素水平不稳定导致的。这种情况下，女孩的月经可能不规律，经量也可能多或少，颜色也可能发黑。随着年龄的增长，HPO轴逐渐发育成熟，月经会逐渐规律。
如果女孩在月经初潮2年后，月经仍然发黑，或伴有痛经、经量过多或过少、经期过长或过短等症状，可能是由疾病引起的，需要及时就医。常见的原因包括：
内分泌失调：下丘脑、垂体、卵巢等器官的功能异常，可能导致内分泌失调，影响月经的正常来潮。
子宫内膜病变：子宫内膜息肉、子宫内膜炎、子宫内膜异位症等疾病，可能导致子宫内膜不规则脱落，引起月经异常。
其他：全身性疾病，如血液病、肝功能损害、甲状腺功能减退等，也可能影响月经。
如果13岁女孩月经发黑，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确病因。在医生的指导下，进行针对性治疗。同时，女孩和家长要注意以下几点：
保持良好的生活习惯：注意休息，避免熬夜；均衡饮食，避免过度节食或暴饮暴食；适量运动，保持心情愉悦。
注意保暖：经期要避免着凉，尤其是腹部，以免引起痛经或加重月经异常。
注意个人卫生：保持外阴清洁，勤换卫生巾，避免感染。
及时就医：如果月经异常持续不缓解或伴有其他不适症状，应及时就医，以免延误病情。