糖皮质激素的副作用较多，包括代谢方面、消化系统方面、骨骼肌肉方面、免疫系统方面等问题。
一、代谢方面副作用
可引起水钠潴留，导致水肿、血压升高；还会影响糖代谢，使血糖升高，甚至诱发类固醇性糖尿病，尤其对于本身有糖尿病病史或肥胖的人群影响更明显。
二、消化系统方面副作用
可能引起胃肠道不适，如胃痛、胃胀、恶心、呕吐，严重时可导致胃溃疡、胃出血，有胃肠道基础疾病的患者需格外警惕。
三、骨骼肌肉方面副作用
长期使用可能导致骨质疏松，使骨骼脆性增加，易发生骨折；还会引起肌肉无力、萎缩等，影响肢体活动功能，老年人等本身骨骼肌肉功能较弱的人群受影响更大。
四、免疫系统方面副作用
会抑制免疫系统，使机体抵抗力下降，容易发生感染，比如呼吸道感染、泌尿系统感染等，且感染后不易控制，儿童等免疫力相对较低的人群更易受影响。