肛门痒有小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.痔疮：内痔或混合痔通常不会引起肛门瘙痒，当内痔或混合痔脱出嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，可导致肛门瘙痒。此外，外痔有时也会伴有瘙痒，尤其是炎性外痔和血栓性外痔。
2.肛裂：肛裂引起的瘙痒，以肛门疼痛、便血和瘙痒为主要症状。
3.肛门湿疹：是一种常见的非传染性皮肤病，病变多局限于肛门周围皮肤，亦偶有蔓延至臀部、会阴及阴蒂，局部可出现红疹、红斑、糜烂、渗出、结痂、脱屑。病程长，肛门周围皮肤常增厚，颜色灰白或暗红、粗糙，以致发生皲裂、渗出、瘙痒，反复发作。
4.肛瘘：肛管直肠周围脓肿破溃或切开引流术后形成肛瘘，由于反复破溃、流脓、炎性渗出，常导致肛门瘙痒。
5.湿疣：肛管内尖锐湿疣，表面凹凸不平，体积增大，可有蒂，易致糜烂、渗出，引发瘙痒。
6.寄生虫病：如蜕虫、蛔虫、阴道滴虫、阴虱、疥疮等，均可引起肛门瘙痒。
7.过敏反应：食用刺激性食物，如辣椒、芥末、香料、酒或特异性蛋白质食物，也有服用某些药物，如磺胺类抗生素等均可因过敏而引起肛门瘙痒。
8.内分泌性疾病：如糖尿病患者皮肤含糖量增高，刺激神经末梢所致瘙痒；甲状腺功能亢进症皮肤亦觉瘙痒，可能与多汗、基础代谢率增高、情绪紧张等有关。
针对以上病因，可以采取以下治疗方法：
1.一般治疗：保持肛门的清洁卫生，尽可能每晚清洗肛门；清洗肛门宜用温水，一般不用肥皂，尤其不能用碱性强的肥皂；内裤宜勤换，不要穿人造纤维内裤，并保持干燥；便纸要用清洁柔软吸水的卫生纸，便后或临睡前要用温水坐浴，保持肛门皮肤有清洁的环境，避免搔抓，忌用肥皂水浸洗和有刺激性的药物薰洗，坐浴。
2.内治法：
中医认为肛门瘙痒多心经有火，下行湿热，或由血虚生风化燥，生虫作痒所致，故以清热利湿，杀虫止痒为治则。
常用方剂为龙胆泻肝汤加减，药用：龙胆草、山栀、黄芩、柴胡、车前子、泽泻、木通、当归、生地、甘草。
3.外治法：
熏洗法：苦参汤加减，药用：苦参、蛇床子、黄柏、川椒、艾叶、公英、马齿苋、赤芍、丹皮。水煎后先熏后洗，每日2次。
敷药法：青黛散或黄连膏外敷，每日1-2次。
4.其他疗法：
封闭疗法：有止痒作用，可使局部皮肤神经末梢麻醉，达到止痒效果。
针灸疗法：针刺长强、三阴交、血海、足三里等穴位。
局部注射疗法：以0.25%普鲁卡因注射液2-5ml加泼尼松龙混悬液0.5-1ml，根据病变部位的不同，在不同的穴位进行局部注射，每周1次，一般1-3次可愈。
需要注意的是，以上内容仅供参考，具体治疗方法请在医生的指导下进行。如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。