牙根发黑可能是由于龋齿、牙结石、牙髓坏死等原因引起的。以下是一些处理方法：
1.龋齿：如果牙根发黑是由于龋齿引起的，需要及时就医进行补牙治疗。如果龋齿已经发展到牙髓，可能需要进行根管治疗。
2.牙结石：牙结石是导致牙根发黑的常见原因之一。可以通过洗牙的方式去除牙结石，恢复牙齿的本来颜色。
3.牙髓坏死：如果牙根发黑是由于牙髓坏死引起的，需要进行根管治疗，去除坏死的牙髓组织，然后进行牙冠修复。
4.其他原因：牙根发黑还可能是由于药物、外伤等原因引起的。如果是由于药物引起的，一般不需要特殊处理。如果是由于外伤引起的，需要根据具体情况进行治疗。
总之，如果发现牙根发黑，需要及时就医，进行详细的口腔检查，确定病因，然后采取相应的治疗方法。同时，要注意口腔卫生，定期洗牙，预防龋齿和牙结石的形成。