小脑扁桃体下疝畸形多因小脑扁桃体疝入椎管的后脑延髓异常所致，治疗方法如下：
1.手术治疗：目的是为了解除枕骨大孔和上颈椎对小脑、脑干及脊髓神经的压迫，疏通脑脊液循环，缓解神经受压症状。
后颅窝减压术：可解除小脑扁桃体下疝对延髓、上颈髓的压迫，还可切开蛛网膜粘连，缓解脑积水。
寰枕减压及内固定术：适用于寰枕交界区畸形，如扁平颅底、颅底凹陷、寰枢椎脱位等，可直接去除该区畸形，同时做内固定，可增加该区的稳定性。
神经松解术：可用于脊髓空洞明显，神经症状进行性加重的患者，通过手术松解脊髓、神经根粘连，恢复脊髓功能。
2.其他治疗：包括对症治疗和康复治疗。
对症治疗：用于缓解神经受压症状，如疼痛、共济失调等。
康复治疗：包括物理治疗、作业治疗、语言治疗等，有助于提高患者的生活质量。
小脑扁桃体下疝畸形是一种先天性发育异常，可导致多种神经系统症状，严重影响生活质量。手术治疗是主要的治疗方法，对于病情严重的患者，应及时就医，在医生的指导下选择合适的治疗方案。