明目地黄丸和杞菊地黄丸的区别主要体现在药物成分、功效、主治病症这几个方面，具体如下：
1.药物成分：明目地黄丸主要由熟地黄、酒萸肉、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻、枸杞子、菊花、当归、白芍、蒺藜、煅石决明等中药材组成；杞菊地黄丸则是由枸杞子、菊花、熟地黄、酒萸肉、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻等中药材制作而成。
2.功效：明目地黄丸具有明目、滋阴、养肝的功效；杞菊地黄丸具有滋肾养肝的功效。
3.主治病症：明目地黄丸主要用于治疗肝肾阴虚、目涩畏光、视物模糊、迎风流泪等病症；杞菊地黄丸一般用来治疗肝肾阴亏、眩晕耳鸣、羞明畏光、迎风流泪、视物昏花等病症。
需要注意的是，在使用这两种药物时，应在医生的指导下按照正确的用法用量服用，避免自行增减剂量。同时，对这两种药物成分过敏的患者禁用，过敏体质者慎用。孕妇、哺乳期妇女、儿童及年老体弱者应在医师指导下服用。如果正在使用其他药品，使用这两种药物前也应咨询医生，以免药物之间发生相互作用。