男性滴虫性尿道炎可以通过药物治疗，以下是一些常用的药物：
1.甲硝唑：对滴虫有较强的杀灭作用，是治疗滴虫性尿道炎的首选药物。通常口服，连用7天。
2.替硝唑：作用机制与甲硝唑相似，疗效优于甲硝唑，服用方法也相同。
3.局部用药：对于尿道炎症状较明显的患者，可以使用甲硝唑栓剂，每晚睡前清洗外阴后，将栓剂放入阴道深部，连用7~10天。
需要注意的是，滴虫性尿道炎具有传染性，性伴侣也应同时接受治疗。在治疗期间，应避免性生活，同时注意个人卫生，保持外阴清洁。此外，应遵循医生的建议，按时服药，并在症状完全消失后复查，以确保治愈。如果对药物治疗有任何疑问或出现不良反应，应及时咨询医生。