一般来说，结石直径小于0.6厘米时，通常采用保守治疗，多喝水、多运动，辅助排石药物，有可能将结石排出体外；当结石直径大于2厘米时，通常需要碎石治疗；当结石直径在0.6至2厘米之间时，具体治疗方法则需要根据结石的位置、形态、患者的身体状况等因素来决定。
结石能否自行排出还与结石的位置有关。一般肾上盏和中盏的结石，由于重力作用，更容易排出；肾下盏的结石，由于位置较低，且输尿管的三个生理狭窄部位位于肾盂输尿管连接部、输尿管跨过髂血管部位、输尿管的膀胱壁段，结石排出过程中容易受阻，自行排出的可能性较小。
碎石治疗包括体外冲击波碎石和输尿管镜碎石取石术等。体外冲击波碎石是利用体外冲击波聚焦后击碎体内的结石，使之随尿液排出体外。输尿管镜碎石取石术是通过尿道插入输尿管镜，在直视下用激光或气压弹道将结石击碎取出。
需要注意的是，碎石治疗并不能保证一次成功，部分患者可能需要多次治疗。此外，碎石治疗也有一些并发症，如血尿、疼痛、感染等。因此，在进行碎石治疗前，医生会对患者进行详细的评估，包括结石的大小、位置、数量、肾功能等，以制定个性化的治疗方案。
除了治疗外，预防结石的形成也非常重要。患者应注意多饮水，保持尿量在2000毫升以上，以增加尿量，稀释尿液，减少尿盐沉淀；调整饮食，减少富含草酸、嘌呤的食物摄入，避免高盐、高蛋白饮食；积极治疗尿路感染等疾病。