早上身高比晚上高3cm是一种正常的生理现象，主要与脊柱的结构变化有关。
脊柱由椎间盘连接的椎体组成，椎间盘富有弹性，有缓冲作用。白天脊柱承受身体的重量，椎间盘被压缩，晚上睡觉时，身体得到放松，椎间盘恢复原状，脊柱的长度增加，身高也就相应增加。
此外，关节囊、关节腔中的关节液也有一定的膨胀作用，使得晨起时身高略高于晚上。
需要注意的是，如果身高差距过大或伴有其他不适症状，如疼痛、僵硬等，可能是疾病引起的，如脊柱病变、关节疾病等。此时应及时就医，进行详细的检查和诊断。
为了保持良好的脊柱健康，建议保持正确的坐姿和站姿，避免长时间弯腰或久坐；适度进行体育锻炼，增强背部肌肉力量；选择合适的床垫和枕头，保证睡眠质量。
总之，早上身高比晚上高3cm是正常的生理现象，不必过于担心。如果对此有疑虑或担忧，可以咨询医生的建议。