三个月婴儿小鸡头红肿，可能是以下原因导致：
1.感染：如尿布疹、龟头炎等，可能会导致小鸡头红肿。
2.过敏：婴儿的衣物、尿布或某些食物过敏，也可能引起小鸡头红肿。
3.损伤：小鸡头受到摩擦、挤压或损伤，可能会导致红肿。
4.包茎：如果婴儿有包茎，包皮无法翻开清洗，可能会导致龟头炎，引起红肿。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.保持小鸡头清洁干燥，每天用温水清洗，避免使用刺激性的清洁剂。
2.更换柔软、透气的尿布，避免摩擦。
3.如果是过敏引起的，要寻找过敏原并避免接触。
4.如果红肿严重，伴有疼痛、发热等症状，可能是感染引起的，需要及时就医，医生可能会开一些抗生素药膏或口服药物。
5.如果是包茎导致的，医生可能会建议进行包皮环切术。
总之，如果三个月婴儿小鸡头红肿，家长应该注意观察，如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。同时，要注意保持小鸡头的清洁干燥，避免感染。