月经推迟三天且阴道有褐色分泌物流出，可能是以下原因导致：
1.怀孕：如果有性生活且没有采取避孕措施，月经推迟三天并伴有阴道褐色分泌物，可能是怀孕引起的先兆流产或宫外孕。可以通过验孕棒或早孕试纸检测，或者到医院进行血HCG和孕酮检测，以及B超检查，以确定是否怀孕以及孕囊的位置。
2.内分泌失调：长期的精神压力、情绪波动、熬夜、节食减肥等因素，可能导致内分泌失调，影响月经周期。此外，一些疾病，如多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等，也可能导致内分泌紊乱，引起月经失调。
3.妇科炎症：阴道炎、宫颈炎、子宫内膜炎、盆腔炎等妇科炎症，也可能导致阴道褐色分泌物和月经推迟。
4.其他因素：子宫内膜息肉、子宫肌瘤、卵巢囊肿等妇科疾病，以及甲状腺功能减退、肾上腺皮质功能亢进等内分泌疾病，也可能引起月经异常。
对于这种情况，建议及时就医，进行详细的检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意休息，保持良好的生活习惯，避免过度劳累和精神紧张。如果是怀孕引起的异常情况，需要根据具体情况采取相应的措施，如保胎治疗或手术治疗。如果是其他疾病导致的，需要积极治疗原发病。此外，在治疗期间，应避免性生活，注意个人卫生，保持外阴清洁。