引起肚子疼并伴有褐色分泌物的原因有很多，以下是一些常见的原因和建议：
1.先兆流产或宫外孕：如果女性处于育龄期，且有性生活，月经推迟后出现肚子疼和褐色分泌物，可能是先兆流产或宫外孕。需要及时就医，进行B超、血HCG等检查，以确定孕囊的位置和发育情况。如果是先兆流产，需要卧床休息，必要时进行保胎治疗；如果是宫外孕，需要及时住院治疗，以免发生危险。
2.妇科炎症：如子宫内膜炎、宫颈炎、盆腔炎等，也可能导致肚子疼和褐色分泌物。同时，还可能伴有白带异常、异味、瘙痒等症状。需要进行妇科检查、白带常规等检查，以明确诊断，并在医生的指导下进行抗炎治疗。
3.排卵期出血：在排卵期，由于雌激素水平短暂下降，使子宫内膜失去激素的支持而出现部分子宫内膜脱落，引起有规律性的阴道出血，这是正常的生理现象，一般不需要特殊处理。
4.其他：如子宫肌瘤、卵巢囊肿、子宫内膜异位症等，也可能引起肚子疼和褐色分泌物。此外，内分泌失调、节育环、外伤等也可能导致这种情况。
总之，肚子疼并伴有褐色分泌物可能是一种严重的信号，也可能是一种正常的生理现象，但无论如何，都需要引起重视，及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，在日常生活中，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免过度劳累和剧烈运动，注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物。